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体外细胞水平 CRISPR/Cas9 基因编辑服务

从靶点设计到测序验证,在培养细胞中完成单基因敲除、多基因敲除与基因表达调控(CRISPRa / CRISPRi)。质粒、慢病毒、腺病毒三种递送方式可选,按细胞特性与实验目的选择最合适的一种。

服务概述

CRISPR/Cas9 系统由 Cas9 核酸酶和 sgRNA 两部分组成。sgRNA 与靶序列互补配对,将 Cas9 引导至指定位点;Cas9 在 PAM 上游约 3 bp 处切割 DNA,形成双链断裂(DSB)。细胞随后启动修复,其中非同源末端连接(NHEJ)常产生少量碱基插入或缺失。若突变发生在编码区,可引起移码突变和基因功能丧失。

递送方式可按实验目标选择:

三条路。质粒靠转染,慢病毒和腺病毒靠感染。

方案一
质粒
适合转染效率较高的细胞,用于短期验证。无需病毒包装和滴度测定,周期相对最短。
方案二
慢病毒
适合难转染细胞、原代细胞、悬浮细胞,或需构建稳转株、开展文库筛选。通过感染进入细胞。
方案三
腺病毒
适合不希望外源序列整合入基因组、同时需要较高感染效率的原代细胞等。
技术原理速览
1
定位
sgRNA 与靶序列配对,把 Cas9 带到指定位点
2
切割
Cas9 在 PAM 上游切开,形成双链断裂
3
修复
细胞启动 NHEJ,断端常有少量碱基插入或缺失
4
敲除
编码区移码,基因功能丧失,这就是 KO
细胞水平基因编辑能做什么
基因敲除(KO)

sgRNA 引导 Cas9 在靶位点产生双链断裂,细胞修复时引入插入或缺失突变,导致基因移码与功能丧失。该策略技术成熟,应用广泛。

多基因敲除

可同时转染针对多个基因的 gRNA,或先构建 Cas9 稳转细胞株,再逐个导入 gRNA。靶基因数量越多,难度越高,筛选策略应在方案阶段确定。

表达调控(CRISPRa / CRISPRi)

dCas9 融合转录激活或抑制元件,不改变 DNA 序列,仅调控转录水平。适用于必需基因研究或需要可逆调控的实验。

非编码基因敲除

lncRNA、miRNA、circRNA 的编辑策略与编码基因不同,需结合转录本结构和剪接位点单独评估。

三种递送工具怎么选
对比项质粒慢病毒腺病毒
是否整合基因组不整合整合不整合
进入细胞方式转染感染感染
适用细胞转染效率高的细胞系难转染细胞、原代细胞、悬浮细胞原代细胞、难转染细胞
表达时长瞬时(数天)长期稳定较强但随时间衰减
载体容量5-8kb≤4 kb;插入增大可影响滴度常用约 7–8 kb
主要局限难转染细胞效率低整合带来插入风险高 MOI 可能有细胞毒性
典型场景快速验证稳转株构建、文库筛选不希望改变基因组的实验
质粒递送 CRISPR/Cas9
可构建载体

sgRNA 表达载体:U6 等 Pol III 启动子驱动。每个靶基因建议设计 3–4 条 sgRNA 并联筛选,以降低单条效率不足导致的返工。

Cas9 表达质粒:常规 SpCas9,或带筛选标记、荧光标签的融合形式,如 pSpCas9(BB)-2A-EGFP/PURO,同时携带 EGFP 和嘌呤霉素抗性,便于转染后药筛或流式富集。

Cas9-sgRNA质粒:sgRNA 和 Cas9 在同一个载体上,一次转染完成导入。

Cas9n 双切口与 dCas9 系统:前者降脱靶,后者做表达调控。

元件怎么挑

启动子:sgRNA 常用 U6 等 Pol III 启动子;Cas9 常用 CBh、EFS、EF1a 等 Pol II 启动子。启动子强度需与表达量、脱靶风险平衡,并非越高越好。

标记:抗性基因(Puro/Bsd/Neo)用于药筛富集;荧光蛋白(EGFP/mCherry)用于评估转染效率和分选。转染效率较低的细胞,建议选择带标记载体。

单载体还是双载体:Cas9-sgRNA 单载体操作简便,适合转染效率高的细胞;双载体在后续病毒包装中更灵活。

质粒依赖转染,难转染细胞效率有限,且表达呈瞬时衰减。这两类建议选择慢病毒腺病毒

慢病毒递送 CRISPR/Cas9
适用细胞

慢病毒通过感染进入细胞,不依赖转染,可覆盖原代细胞、悬浮细胞、神经元、免疫细胞等。构建敲除细胞株通常采用该方式。

病毒形式

sgRNA 慢病毒:感染已稳定表达 Cas9 的细胞系。片段较小,滴度较高,适合文库筛选和多靶点并行。

Cas9 慢病毒:先建立 Cas9 稳转株,再导入 sgRNA,适合需要反复更换靶点的项目。

Cas9-sgRNA 慢病毒:一次感染完成系统导入,操作最省事。

可诱导、条件性表达系统:用于控制编辑发生时间,减少持续表达带来的脱靶累积。

sgRNA 文库慢病毒:按项目规模包装,重点关注滴度和文库覆盖度。

腺病毒递送 CRISPR/Cas9
对难感染细胞的优势

基因组保持干净:腺病毒以游离体形式存在于细胞核内,不整合入基因组。后续需测序或不愿引入插入突变的实验可优先考虑。

原代细胞也能打进去:通常高于质粒转染,且载体容量大于 AAV,可容纳 SpCas9 全长。

表达强但衰减快:编辑窗口主要集中在前一阶段,随后表达下降。需长期稳定表达时建议选择慢病毒。

体外与在体要求不同

腺病毒可用于体外细胞感染,也可通过尾静脉等途径用于动物在体编辑。但在体应用对病毒纯度和内毒素要求显著高于体外,方案阶段需明确用途。若需长期、组织特异性在体编辑,AAV-SaCas9 更合适。免疫原性和通用技术参数见 腺病毒包装服务

服务流程
STEP 1
需求确认与方案设计
周期按当前排期确认
STEP 2
sgRNA 设计与评估
每靶点 3 到 4 条
STEP 3
载体构建与测序验证

STEP 4
递送至细胞(三选一)
质粒 / 慢病毒 / 腺病毒
STEP 5
编辑效果验证
T 载体测序为主
STEP 6
交付
质粒或病毒液加报告
交付标准与质控
交付项规格检测方式说明
重组质粒10μg琼脂糖凝胶 + 测序双重验证转染级 / 常规级可选
慢病毒液1mL,108TU/ml滴度测定附滴度测定结果
腺病毒液1mL,1010PFU/ml滴度测定 + 纯度检测在体用途需额外纯化
测序报告覆盖 sgRNA 插入区与关键元件Sanger 测序确认序列完全正确
载体图谱文件.gb / .dna 各 1 份可直接导入常用分子生物学软件
无菌检测阴性常规质控常规项
支原体检测阴性常规质控常规项
内毒素检测<0.1EU/μg(按交付物类型执行)LAL 法腺病毒用于动物在体时必检

注:具体质控标准以项目合同和 COA 为准。

典型应用场景
基因功能研究
敲掉候选基因看表型,验证基因与通路的因果关系。
药物靶点验证
敲除后评估增殖、凋亡与药物敏感性。
信号通路解析
多基因敲除查基因家族冗余,或 CRISPRa / CRISPRi 做可逆调控。
疾病模型构建
在疾病相关细胞系里引入敲除,配合后续组学分析。
交付案例与发表文献
SCAP HL-7702 人正常肝细胞 · 慢病毒递送

研究 SCAP 在脂质代谢与自噬调控中的作用。交付单克隆敲除细胞株,附 STR 鉴定报告与 T 载体测序验证。

发表于 Autophagy,合作单位中国药科大学
NSUN2 BGC-823 人胃癌细胞 · 慢病毒递送

研究 RNA 甲基化修饰在肿瘤细胞中的功能。交付单克隆敲除细胞株与完整鉴定报告。

发表于 Cell Death & Disease,合作单位温州医科大学附属第二医院
AAV-SaCas9 肌肉组织 · 在体编辑

在肌肉组织完成在体基因编辑,属在体应用场景。

1066vip威尼斯合作发表的基因编辑论文
腺病毒 小鼠肝脏 · 尾静脉给药

尾静脉注射感染小鼠肝脏并完成目的基因编辑,对纯化和内毒素要求更高。

合作单位华中农业大学
常见问题
能保证一定敲除成功吗?
不能。基因编辑效率受靶位点、细胞类型和递送方式共同影响。我们可保证 sgRNA 经过设计与筛选、测序验证完整、交付物基因型明确;首轮效果不达预期时,提供备选 sgRNA 方案。
一个基因要设计几条 sgRNA?
建议 3–4 条并联测试。单条 sgRNA 效率不足是返工的主要原因之一。
需要多长时间?
质粒构建相对最快。病毒包装需增加包装和滴度测定环节;腺病毒在体应用还需计入纯化和检测时间。具体周期请咨询销售。
自行设计 sgRNA,只委托构建载体可以吗?
可以。提供序列后进入构建环节,我们会进行序列可行性形式检查。
质粒能用于原代细胞吗?
一般不推荐。原代细胞转染效率通常较低,难以获得足够编辑细胞。建议选择慢病毒或腺病毒。
整合进基因组有影响吗?
有。整合可换取长期稳定表达,适合构建稳转株;若不希望改变基因组,或希望表达随时间衰减,腺病毒更合适。
能做 sgRNA 文库筛选吗?
可以。文库对滴度和覆盖度要求高于单靶点,需在方案阶段明确规模和筛选压力。
腺病毒载体装得下 Cas9 吗?
装得下。腺病毒容量较大,可容纳 SpCas9 全长。受容量限制更明显的是 AAV,因此 AAV 方案常采用较小的 SaCas9。
腺病毒有细胞毒性吗?
高 MOI 下可能出现,是腺病毒项目的常见风险点。方案阶段会给出建议感染条件,必要时通过预实验确定安全范围。
腺病毒能用于动物在体吗?
可以,尾静脉等途径均可。在体应用对纯度和内毒素要求高于体外,需求阶段需说明用途。若需长期、组织特异性在体编辑,AAV-SaCas9 更合适。
客户发表文献节选
Anterior cingulate cortex dysfunction underlies social deficits in Shank3 mutant mice
(杂志: Nature Neuroscience,西安第四军医大学)
SLE non-coding genetic risk variant determines the epigenetic dysfunction of an immune cell specific enhancer
(杂志: Nature Communications,上海交通大学医学院附属仁济医院)
Discovery of a potent SCAP degrader that ameliorates HFD-induced obesity, hyperlipidemia and insulin resistance
(杂志: Autophagy,中国药科大学)
Prevention of Muscle Wasting by CRISPR/Cas9-mediated Disruption of Myostatin In Vivo
(杂志: Molecular Therapy,中科院营养所 / 1066vip威尼斯研究中心)
NSUN2 modified by SUMO-2/3 promotes gastric cancer progression and regulates mRNA m5C methylation
(杂志: Cell Death & Disease,温州医科大学附属第二医院)
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